竞博体育官方平台官网|戴奈米克官网|中国科研人员开发病毒分类新工具 大幅提升病毒

发布时间 :2024-06-142025-03-30 竞博JBO官网化学集团

  中新网青岛3月11日电(胡耀杰 王禹)记者11日从中国海洋大学获悉★ღ★★,该校海洋生命学院汪岷教授团队基于序列比对和图论方法戴奈米克官网★ღ★★,开发了病毒分类新工具Viral Taxonomic Assignment Pipeline(VITAP)★ღ★★。该成果近日在国际知名期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上发表★ღ★★,为病毒组学和病毒生态学研究提供了重要工具★ღ★★。

  病毒不仅对人类健康产生深远的影响jbo竞博app下载★ღ★★,★ღ★★,也是全球生物地球化学循环的幕后推手竞博jbo官网★ღ★★。★ღ★★。目前大多数病毒分类方法主要依赖于接近完整的病毒基因组数据★ღ★★,对片段化和不完整的病毒序列分类效果较差竞博jbo亚洲第一电竞平台★ღ★★。此外竞博体育官方平台官网★ღ★★,目前的技术手段大多对双链DNA病毒的分类效果较好★ღ★★,而对RNA病毒和单链DNA病毒的高通量准确分类仍存在困难竞博体育官方平台官网★ღ★★。特别是对于高度不完整的病毒片段戴奈米克官网★ღ★★,如何将其准确地进行分类仍然是一个亟须解决的问题竞博体育官方平台官网★ღ★★。

  上述问题限制了业界对环境中复杂病毒群体的深入解析★ღ★★。如何准确细致地对环境病毒进行分类竞博体育官方平台官网jbo竞博最新官网★ღ★★,★ღ★★,已成为当今生物学竞博体育官方平台官网jbo竞博·(中国)电竞官网★ღ★★,★ღ★★、医学与生态学研究亟待突破的重要挑战★ღ★★。

  该研究团队开发的VITAP通过结合序列比对与图论算法★ღ★★,不仅能对DNA及RNA病毒进行精准分类★ღ★★,还为每个分类单元提供了置信度评估★ღ★★,可对长度短至1000个碱基对的病毒基因组序列进行从门到属水平的高效分类★ღ★★,并大幅提升了病毒注释率★ღ★★。

  此外戴奈米克官网★ღ★★,VITAP能够基于国际病毒分类委员会(ICTV)制定的最新分类数据库进行自动更新戴奈米克官网戴奈米克官网★ღ★★,并支持用户自定义分类数据库★ღ★★。

  在后续的分析测试中竞博jbo电竞首页★ღ★★,该研究团队将VITAP方法成功应用于宏病毒组和病毒基因组的注释★ღ★★,结果显示VITAP在科级和属级的分类分析中不仅能保持超过90%的准确率戴奈米克官网竟博官网登录★ღ★★,★ღ★★、精度和召回率★ღ★★,还显示出了优于其他方法的注释率★ღ★★。